9月15日夜間上海市中心城區部分區域出現大面積惡臭異味，市環保、公安等有關部門立即組織力量對相關地區進行排查，16日下午確定上海農藥廠為污染源。

初步調查發現，該廠于15日晚9點40分，由于工人操作不當，造成一生產莎稗磷(除草劑)的反應釜溫度過高，發生沖料事故，閥門破裂，約有300公斤生產莎稗磷原料的混合氣體泄漏。事發后，該廠及時關閉事故工藝設施，未造成進一步污染。由于15日晚氣象條件不利于擴散，事故造成本市中心區域有較大范圍的刺激性氣體蔓延。期間有少量市民感到不適，未造成更大影響。

記者從長海醫院獲悉，15日晚因吸入不明氣體而入院治療的2名女子經過吸氧和輸液治療后，已于16日凌晨3時許離開醫院回家休養。

目前市政府已成立由有關部門組成的調查組，進一步調查事故原因，并將依法追究相關責任。