2013年，農業部將農產品質量安全作為六項重點工作之一，嚴厲打擊“非法添加”和“假冒偽劣”等突出問題，在全國范圍組織開展農藥及農藥使用、“瘦肉精”、生鮮乳違禁物質、獸用抗菌藥、水產品禁用藥物和有毒有害物質、農資打假等6個專項整治行動，取得了階段性進展和成效。

上半年，全國出動執法人員210萬余人次，檢查相關生產經營單位184.5萬余家，取締無證照企業582家，吊銷證照企業184家，查處問題3.4萬余起，立案查處1萬余起，查辦5萬元以上大案要案20余起，向社會公布了7起假劣農資典型案例，有效震懾了違法犯罪分子。在農藥整治上，對近年來市場抽查過程中問題比較突出、舉報投訴較多的企業進行專項抽檢，同時在北京等10省(市)的11市(縣)開展使用低毒生物農藥補貼推廣項目，調動農民選用低毒、生物農藥的積極性。

在獸藥整治上，加強獸藥質量監督抽檢和養殖場(小區、戶)用藥安全監管，深入實施“檢打”聯動，嚴厲打擊超劑量超范圍用藥、違規使用原料藥、不執行休藥期等濫用抗菌藥物的違法行為。在“瘦肉精”整治上，突出抓好養殖和屠宰兩個重點環節，組織開展“瘦肉精”拉網監測，對公布禁用的“瘦肉精”類物質進行全面排查，通報了8起“瘦肉精”典型案例。在生鮮乳整治上，及時制定全國生鮮乳質量安全監測計劃，實現兩個“全覆蓋”，即抽檢覆蓋全國所有奶站，檢測指標覆蓋國家公布的三聚氰胺等5種違禁添加物。水產品整治上，積極開展水產品中禁用藥物殘留快速檢測產品驗證，為各地開展現場執法提供支撐手段。

農業部要求，各級農業部門在開展農產品質量安全專項整治工作過程中，要認真貫徹落實《最高人民法院、最高人民檢察院關于辦理危害食品安全刑事案件適用法律若干問題的解釋》精神，加大大案要案查處力度，進一步完善農產品質量安全執法與刑事司法銜接機制，主動加強與公安、法院、檢察院等部門的聯系，建立健全溝通渠道，完善工作機制，逐步建立線索通報、案件協查、聯合辦案等機制，提高農產品質量安全案件查辦效率;進一步加大執法力度，及時發現危害農產品質量安全犯罪活動線索，嚴肅查處危害農產品質量安全案件，對符合《司法解釋》規定標準的行為，及時通報或移送公安機關，嚴懲違法犯罪分子，將農產品質量安全專項整治工作推行深入。